这个基因测序仪与纸巾盒一样大 华大集团成行业内唯一具备三种不同...
华大生命科学研究院院长、华大集团执行董事徐讯在发布会上表示,目前,基因组上仍然有8%的“暗物质”区域无法检测到;许多微生物基因组GC含量异常,常规测序无法完成组装;现有DNB平台面对复杂结构变异造成的遗传疾病很难解析,也无法实现实时、快速的测序,解决ICU里感染的快速检测需求。WT02是一款中通量的纳米孔基因测序仪,...
华大纳米孔测序仪全球首发:引领全读长时代新纪元 | 追寻新质生产力
面对极端GC含量基因组等技术挑战,CycloneSEQ也能实现环状基因组的完整组装。作为深海测序仪系统之一,它在极端环境下稳定运行,并成功对水体环境微生物进行了原位鉴定。此外,结合多组学工具,CycloneSEQ提供了多维基因组分析,为推动生命科学领域的发展提供了强大支持。华大25载:基因科技造福人类自上个世纪以来,全球步入了...
华大集团两款纳米孔基因测序仪全球首发
面对极端GC含量基因组等技术挑战,CycloneSEQ也能实现环状基因组的完整组装。作为深海测序仪系统之一,它在极端环境下稳定运行,并成功地对水体环境微生物进行了原位鉴定。此外,结合时空组学和细胞组学工具等多组学工具,CycloneSEQ提供了多维基因组分析,为推动生命科学领域的发展提供了强大的支持。生态赋能:给世界更好的...
华大集团发布纳米孔基因测序仪,成为全球唯一具备三种不同技术路径...
基因组上仍然有8%的‘暗物质’区域无法检测到;许多微生物基因组GC含量异常,常规测序无法完成组装;现有DNB平台面对复杂结构变异造成的遗传疾病很难解析;也无法实现实时、快速的测序,解决ICU里感染的快速检测需求。面对这些挑战,已有成熟的技术和产品,提升10%,已经是极限。只有打破惯性,寻找提升10倍,甚至100倍的新技术,...
Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这
short-readcDNA测序用于差异基因分析short-read测序是检测和定量转录组范围基因表达的最常见方式,部分原因是因为它比表达芯片更便宜、更易于应用,但更主要的是它可以获得全转录组水平高质量的表达数据。采用Illumina的short-read测序做DGE分析的核心步骤包括RNA提取,cDNA合成,接头连接,PCR扩增,测序和数据分析(图一)。
FSHW | 清华大学邢新会教授:基于转录组的生物功能性多肽挖掘...
中国大鲵肉的转录组和蛋白组解析SMRT测序结果揭示了中国大鲵的肌肉中含有11688个转录本,其平均长度为2999.8bp(最大和最小转录本长度分别为8888和63bp);平均GC含量为47.1%(含量的最大值和最小值分别为23%和63.2%)(图1a和b)(www.e993.com)2024年10月18日。对转录本进行分析可以获得平均长度为1507.8bp的10703个编码区(...
Neuron:当你老了,前额叶皮层怎么变?
不同个体间表观遗传组和转录组具有多样性研究人员对11位捐献者的额叶皮层(本文神经元均取自此处)进行分析,基于非GC甲基化(mCH)特征识别了11种谷氨酸能兴奋性神经元和10种GABA能抑制性神经元。而通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析,细胞类型标记基因的表达与GC甲基化(mGC)和mCH密切相关。对RNA表达和DNA甲基化特征...
单细胞转录组测序的最新进展盘点
引起疟疾的疟原虫非常小,含有极少量的RNA,并且基因组偏向性非常明显,GC含量低至20%,而哺乳动物大约是35-40%。因此,建库的试剂往往不能很好地发挥作用,不过通过增加PCR循环次数和尝试不同的酶,研究人员还是很好地解决了这一问题。生物信息学工具:ASAP
...大学王洲副教授等:副溶血性弧菌生物被膜动态形成机制的转录组...
6、转录组分析转录组数据质量分析对93962274条原始测序reads进行过滤,得到高质量有效reads共92506128条(表1)。6组样本的碱基测序精确度Q30值均达到95%以上,GC含量超过46%,说明测序错误较少且质量较高,可进行下一步分析。将转录组数据上传至NCBI数据库,登记号为PRJNA784512。
IF 10.588=细菌完成图+转录组+代谢组+实验验证
对菌株XH1进行基因组测序得到一条4,203,618bp的染色体,GC含量43.65%,基因预测总共得到4503个基因,在COG、GO、KEGG和Swissport数据库中分别注释到3060,2617,2306和3996个基因。注释结果发现:基因组中有和烃类降解相关的基因,另外因为该菌株长期存在与烃类环境中,其降解烃类化合物的能力被驯化,这一研究表明细菌降...