Cell Res:西湖/清华大学联手实现镜像结合蛋白精确从头设计

我们用「镜子」映照「左手」目标蛋白质,产生镜像对称的、「右手」目标蛋白,然后通过在镜像空间中的设计与测试,得到能与后者结合的「左手」蛋白质,再镜像回来,是否就能获得一个「握住左手的右手」呢?图1镜像结合蛋白的从头设计和定向进化体系为了验证这个新颖的镜像结合蛋白从头设计体系,这支研究团队选取了三种靶蛋...

糖尿病人两种饮食最伤胰腺,保护胰腺的四个方法,这样测胰岛功能

2、口服葡萄糖耐量试验(OGTT)口服葡萄糖耐量试验是评估胰岛对葡萄糖负荷反应能力的重要手段。受检者需在空腹状态下饮用含有75g葡萄糖的溶液,并在服糖后的半小时、1小时、2小时、3小时分别抽取静脉血测定血糖浓度。正常情况下,服糖后血糖会在2-3小时内迅速恢复到正常水平,同时胰岛素水平会在30-60分钟内达到高峰...

如何减小低分辨质谱测蛋白分子量的误差?

1内标蛋白:内标是已知分子量的蛋白质,可以与待测蛋白质一同进行质谱分析。通过比较待测蛋白质与内标蛋白的质谱峰位置和强度,可以校正质谱仪器的误差,从而减小分子量误差。2同位素标记:同位素标记是一种通过添加同位素标记的分子来实现内标校正的方法。通过质谱分析同位素标记的内标蛋白和待测蛋白,可以减小低分辨质谱...

抗病小体,探索植物免疫新途径

尽管我们先前的研究揭示植物NLR可以通过结构域之间的相互作用维持抑制状态,但是许多NLR类蛋白的过表达经常破坏这种自抑制从而导致自发性免疫的发生,并且这种反应经常需要消耗大量的能量,使得植物生长受限、产量下降。但是在茄科中,即便在没有病原菌侵染时,这些蛋白的表达量依然很高。因此,如何在没有病原菌侵染时保持这些...

揭秘细胞转染的关键技能,你知道吗?

另一方面,蛋白水平检测时间的设置也非常重要,由于转录和翻译发生的时间和位点存在时空间隔,并且受细胞内目的蛋白表达量、稳定性、半衰期、甚至其他调控等因素的影响,所以蛋白质水平下降的幅度与mRNA水平下降不一定成线性正比关系。通常情况下,在siRNA转染后48小时进行WB检测,但每个实验中目的蛋白水平的变化快慢并不相同,...

独属人类的“魔法精灵”?藏在你我的大脑里

通过比较基因表达差异,我们发现了2717个基因,这些基因只在人类中被检测到高表达(www.e993.com)2024年11月3日。一般来说,基因的表达量越高,就暗示着该基因有着更加重要的功能。随后,我们用一种分析工具鉴定出基因表达量高的细胞,这些细胞就被我们定义为人脑特异性的细胞群(Human-UniquebrainCellClusters,HUCCs)。

Nature Medicine:检测一滴血中的蛋白质,预测50多种疾病未来十年的...

3、确定疾病蛋白质组学特征的筛查指标是否达到或超过当前临床实践中使用的血液检测指标。研究团队对来自随机选取的41931名英国生物样本库(UKBiobank)参与者的约3000种血浆蛋白质进行了测量,然后将这些参与者的蛋白质组学数据与他们的电子健康记录相关联。

...| 突破质谱细胞术的瓶颈:ACE技术助力低丰度蛋白质检测

分子调控轨迹:图e展示了通过Scorpius分析测量标志物在EMT和MET过程中的分子调控轨迹。结果显示,Zeb1表达的增加发生在EMT后期,伴随着CK14的下调。在反向MET过程中,Zeb1表达的下降与波形蛋白(vimentin)表达的急剧下降相关,而E-cadherin水平的上升则在之前发生。

AlphaFold为什么能精准预测蛋白质结构?

首先,深度学习通常需要庞大的数据集来进行学习,而当时的蛋白质数据库(ProteinDataBank)中只有大约17万条蛋白质数据。这听起来似乎已经不少了,但是我们横向对比一下就知道这个数据量有多么捉襟见肘:同样是在2020年训练的语言模型GPT-3使用了3000亿个token(可以理解为“词”)作为数据集,这可比17万大了许多个数量...

AI 对科学探索推动的边界在哪?蛋白质、气象等领域专家共话AI4S |...

(圆桌主持:叶启威)问题1:在工作中是否面临过数据孤岛的问题?如何解决?张强锋:生命科学是大数据驱动的领域,标准化和标签化的数据对AI在生命科学中的应用至关重要。现实中确实有些问题无法拿到合适的数据。基因表达调控等比蛋白质结构预测更难一些,其中数据量少就是一个原因。临床数据和医学数据通常集中在医院和制药公...