中国科大在人类癌症细胞的多药耐药蛋白的结构和功能研究领域取得...
结构分析表明,apo-formABCC3结构呈现向细胞质基质开口(inward-facing)的构象:两个核苷酸结合结构域(NBD)彼此分开,两个跨膜结构域(TMD)形成一个朝向细胞质基质开放的“V形”底物转运通道。与经典的ABC转运蛋白不同,其N端有一个额外的五股跨膜螺旋组成的TMD0结构域。TMD0的五股跨膜螺旋聚拢在一起,形...
独创方法提升蛋白质结构预测精度 腾讯AI Lab联合研究登上Nature子刊
通过自研的提升蛋白质结构预测精度的新方法,联合研究团队首次解析了II型5a还原酶(SRD5A2)的三维结构,揭示了治疗脱发和前列腺增生的药物分子“非那雄胺”对于该酶的抑制机制,这将有助于深化研究相关疾病的病理学机制及药物优化
新算法揭示蛋白质进化秘密
研究团队将该算法应用于“阿尔法折叠”数据库中2亿个已被预测的蛋白质结构,识别出了200多万个独特的结构聚类——一组在三维形状上彼此相似的蛋白质结构,其中1/3的聚类以前没有被描述或分类。研究团队指出,了解蛋白质结构对于研究其功能和进化至关重要,尽管科学家在基于序列的蛋白质结构预测方面取得了重大进展,但计...
中国科学技术大学结合计算预测和设计揭示无序蛋白结构域的靶标...
在该研究成果中,作者先用基于二氢叶酸还原酶的蛋白质互补分析体系来高效检测无序片段间的相互作用,系统研究了位点突变和截短对互作的影响,发现实验结果与AlphaFold2预测的α/β型复合物结构模型吻合;作者进一步用蛋白质序列设计深度学习模型ABACUS-R基于结构设计了多个突变体,成功获得一个突变体的晶体并解析了其结构。...
...多尺度研究院马剑鹏团队在计算生物学取得突破,实现蛋白质结构...
这一新方法能有效建立高精度的生物大分子结构模型,帮助解决药物设计中因目标蛋白结构不准而导致的新药研发失败问题。研究人员介绍,生物大分子的许多重要功能是通过其高度的柔性特质来完成的,但柔性也是负面影响结构测定精度的主要因素。在处理冷冻电镜数据的过程中,生物大分子结构柔性引起的构象多样性使得从单个样本中...
对话复旦复杂体系多尺度研究院院长:蛋白质结构预测为何突破
“蛋白质结构预测不是一个新的领域,学术界已经做了50多年了,一直没有突破性成果,为什么谷歌旗下的DeepMind公司做到了?”10月31日,在世界顶尖科学家生命科学3.0与交叉研究论坛期间,复旦大学复杂体系多尺度研究院院长在接受澎湃新闻(thepaper)记者采访时表示,对这一问题的思考对我们非常有启发意义(www.e993.com)2024年9月19日。
人工智能终结了蛋白质研究吗?一文读懂蛋白质折叠的前世今生
下:从左往右依次为胶原蛋白、让组织成型;萤火虫萤光素酶、发光;抗体、鉴别外来物质;胰岛素、调节血糖;淀粉酶、消化淀粉;瘦素、控制食欲。图源:RCSBPDB当谷歌的公关部门向全世界发布这一消息时,媒体为之疯狂。AlphaFold2“将会改变一切”的说法占据了各大新闻的头版头条。那些毕生致力于研究单个蛋白质结构的蛋白质生...
探索蛋白质结构解析的新途径与方法
这种方法加速了蛋白质结构解析的速度和效率,有助于快速识别潜在药物靶点和设计新药物。2.线粒体蛋白质结构解析:线粒体是细胞中的重要细胞器,其内部存在许多关键的蛋白质。近年来,科学家们对线粒体蛋白质结构的研究越来越重视。通过应用各种高分辨率的技术,如冷冻电子显微镜(cryo-EM)和单粒子分析等,科学家们已经...
科学家揭示关键线粒体蛋白结构,助推线粒体相关的人类疾病研究
第三阶段,验证结构在细胞中的功能和作用。与其他蛋白质结构解析的研究相比,该研究的特色之处在于,不仅利用结构生物学方法解析出了蛋白结构,还通过与细胞生物学家的进一步合作,探索这一结构在细胞中扮演的角色和功能,以便更好地了解其在细胞、个体,甚至疾病中的作用。
不只是AlphaFold!一文读懂蛋白质折叠的前世今生:从“不可能”到...
图|JohnKendrew(左)和MaxPerutz(右)利用X射线晶体学技术揭示了血红蛋白和肌红蛋白的结构。随后,他们用球(代表原子)和棒(代表化学键)建立了物理模型。(来源:MRCLaboratoryofMolecularBiology)从那时起,无数研究人员不仅努力了解不同蛋白质的外观,还试图了解它们如何形成那样的外观。“了解事物的外观...