STM丨汪秀星/张弩合作揭示非经典开放阅读框编码肽段MPEP促GBM恶性...

短开放阅读框(ORF)是真核DNA的共同特征。最新研究进展提示人类基因组中短ORF具有翻译潜力。许多可翻译的短ORF已被鉴定在具有已知编码DNA序列(CDS)的mRNA转录本的5'非翻译区(5'-UTR)或3'非翻译区(3'-UTR)内,甚至在以前被认为是非编码的RNA转录本中。mRNA翻译稳态的精细调控对于维持正常组织和预防肿瘤发生至关重...

Cell:从人体微生物组中挖掘全新抗菌肽,有望解决抗生素耐药性难题

该研究通过计算筛选,从人体微生物组(包括皮肤微生物、口腔微生物、肠道微生物)中挖掘候选抗菌肽,共鉴定出323个由小开放阅读框编码的潜在抗菌肽,其中合成的78个候选抗菌肽中有55个(70.5%)在体外具有抗菌活性,来自肠道细菌普雷沃氏菌Prevotellacopri编码的prevotellin-2具有与常用抗生素多粘菌素B相当的抗菌活性。尽...

【云飞杂记】真菌传之基因组

云飞:在分子生物学中,开放阅读框是开始于起始密码子,结束于终止密码子,连续的碱基序列,是DNA序列中具有编码蛋白质潜能的序列。健客:内含子是什么意思?云飞:内含子是基因中在编码RNA剪切后切除的部分。与之对应的是外显子,是基因中在编码RNA剪切后保留的部分,绝大部分的外显子为编码序列。健客:今天太难啦!

【文献】神经元活动通过eIF4G2与uORF结合快速重编程树突翻译过程

uORF(上游开放阅读框):是一类能够精确控制蛋白质翻译的mRNA元件。成熟mRYA的5′UTR中一种转录后调控元件,它能够调控下游主要开放阅读框(mORF)的翻译水平。eIF4G2(真核翻译起始因子4伽玛2)基因有31个转录本、280个直系同源物和2个旁系同源物。在甲状腺、胎盘(RPKM201.0)和其他25种组织中普...

Nat Biotechnol:提供对翻译开放阅读框的标准化注释

在过去的几年里,人类基因组中发现了数千个非常小的开放阅读框(openreadingframe,ORF)。这些DNA序列可能包含构建蛋白的指令。这项新研究的几位作者之前已经发现了ORF,并在科学杂志上对它们进行了描述:vanHeesch与MDC教授NorbertHübner和UweOhler一起描述了人类心脏中的新的微型蛋白(mini-protein),并在2019年...

全球与中国全长ORF(开放阅读框)克隆市场发展前景与投报告2022

从产品产品类型方面来看,慢病毒表达系统占有重要地位,预计2028年份额将达到%(www.e993.com)2024年12月20日。同时就应用来看,生物技术公司在2021年份额大约是%,未来几年CAGR大约为%。从企业来看,全球范围内,全长ORF(开放阅读框)克隆核心厂商主要包括ThermoFisherScientific、GeneCopoeia、Dharmacon、BioCatGmbH和SourceBioScience等。2021年,全...

非典型开放阅读框编码癌细胞存活所必需的功能蛋白

美国哈佛和麻省理工学院ToddR.Golub研究团队的最新研究揭示了非典型开放阅读框(ORF)编码癌细胞存活所必需的功能蛋白。这一研究成果于2021年1月29日发表在国际学术期刊《自然-生物技术》上。研究人员运用实验方法检测了从非典型ORF数据集中选择的553个候选阅读框。其中,去除57种ORF会导致人类癌细胞系生存能力缺陷。

如何快速批量找到转录本序列的开放阅读框(ORF)

做完转录组后,我们会获得很多基因的转录本序列,如何分析这些转录本序列的开放阅读框(ORF),然后找到对应的蛋白呢?今天就为大家介绍一下使用频率最高的软件,NCBI的ORFFinder,以及另一款可以进行批量分析的软件getORF。1.ORFFinderORFFinder是NCBI开发的一个在线分析转录本序列ORF的工具,与NCBI整合地很好。在百度里...

发现新基因!表明人类仍在进化……

人们在很长一段时间都认为,可以编码蛋白的基因位于人类基因组中的“开放阅读框(ORF)”。“开放阅读框”是从初始密码子到终止密码子的连续碱基序列,也是DNA序列中具有编码蛋白质潜能的序列(密码子是指信使核糖核酸上决定1个氨基酸的3个相邻碱基的排列顺序,代表某一种氨基酸的规律)。

新基因研究表明人类仍在进化

人们在很长一段时间都认为,可以编码蛋白的基因位于人类基因组中的“开放阅读框(ORF)”。“开放阅读框”是从初始密码子到终止密码子的连续碱基序列,也是DNA序列中具有编码蛋白质潜能的序列(密码子是指信使核糖核酸上决定1个氨基酸的3个相邻碱基的排列顺序,代表某一种氨基酸的规律)。