鹦鹉博尔纳病毒的鉴定与M基因遗传进化分析

本试验设计合成1对特异性引物,对疑似感染鹦鹉博尔纳病毒而死亡的鹦鹉进行检测,并设计1对鉴定引物对博尔纳病毒M基因进行RT-PCR扩增、测序,应用DNAStar与MEGA6.06软件将本次获得的PaBV-5与GenBank上公布的PaBV序列进行同源性和遗传进化分析,同是也做影像学与组织病理检测。

Nature重磅综述 |关于RNA-seq,你想知道的都在这

标签测序法采用随机引物或带有oligo-dT的引物进行PCR扩增分选出转录本的3’末端的同时加上接头序列,优化掉了poly(A)富集、rRNA移除和接头连接等步骤。这一方法可以在更低的测序深度条件下达到与标准RNA-seq相当的敏感性,因此可以混合更多样本同时测序。因为不需要考虑外显子连接检测(exonjunction)和基因长度归一化,...

...江汉大学彭海教授等:基于二代测序技术的玉米内标准基因扩增子...

花生(1个样品)、西瓜(2个样品)、黄瓜(2个样品)、甜瓜(2个样品)、番茄(2个样品)、辣椒(2个样品)、白菜(2个样品)10个非玉米物种的25个样品,对这些内标准基因的扩增子进行种间特异性评估,结果发现这25个样品均未建库成功,理论上来讲这是由于建库所用的引物是针对玉米内标准基因特异设计而造成。

服务全球2万+客户、近百亿碱基合成经验,这家企业致力成为合成生物...

在合成工艺方面,AlphaGS的基因合成引物拼接PCR工艺通过专有HiFiGSMix试剂,结合标准化PCR扩增程序设计,使基因合成引物拼接成功率拼接长度提高数倍;其基因合成片段与载体克隆工艺则是通过专利的同源重组Syno??AssemblyMix试剂与高通量转化工艺,可使基因克隆效率与通量整体提高10倍以上。泓迅生物公布的数据显示,自2018...

学术大爆发!中国/华人学者一天发表35篇Nature Communications|...

此外,对高阶基因组结构的分析表明,在SETDB1缺失的细胞中,包括拓扑相关结构域和亚核区室在内的大染色质结构保持完整。然而,染色质环和局部3D相互作用被破坏,通过修改预先存在的染色质景观导致转录变化。表达改变的特定基因与失调的顺式调控元件表现出不同的相互作用。总的来说,该研究发现SETDB1的细胞类型特异性靶点...

一例罕见型地中海贫血引发的思考

此时我们注意到了这个特殊的位点组合,从正常的实验角度来说,当出现α基因中SEA缺失复合3.7缺失的杂合子情况时,阴性对照点(NP)应该是呈现对照点不出的现象(如图2),解释为:NP为染色体上α2基因的部分片段,位于α2基因的后半部分,为α缺失的正常对照(引物设计相关原理可见图3)(www.e993.com)2024年11月19日。

RT-PCR引物设计原则和方法

引物确定后,对于上游和下游引物分别进行Blast分析,一般来说,多少都会找到一些其他基因的同源序列,此时,可以对上游引物和下游引物的blast结果进行对比分析,只要没有交叉的其他基因的同源序列就可以。有一个问题,引物设计原则里面常常强调,引物所对应模板序列的Tm值最好在72℃左右,但是软件里面Search出来的引物,很少有达...

《杜仲全基因组精细图》绘制完成重大成果新闻发布会

我们进行了杜仲叶绿体基因测序。我们探索出高杂合度林木基因组测序方法。林木遗传背景复杂,杂合度高,全基因组测序组装带来了难以克服的困难。我们建议以后做基因组的时候用20-30对的SSR引物,对测物种进行遗传多样性和群体遗传结构分析,找出相对纯合个体。杜仲筛选杂合度低的个体进行测序,发现这些个体的杂合度在0.19-...

特邀专家方法 | 刘耀光:基于CRISPR编辑系统的DNA片段删除技术

在获得阳性的T0转化植株后,需要进一步确认植株是否发生目标基因组片段删除或靶位点序列是否存在突变。根据实验目的和目标删除片段的大小,设计相应的扩增引物和测序引物进行检测。根据目标删除片段的大小(本方法以800bp为界限,可适当调整),提供以下2种扩增方法作为参考(图3A–C)。

体外法研究酵母发酵饲料对瘤胃发酵参数及瘤胃细菌数量的影响

用普通PCR检测所设计引物的特异性,反应体系:PCRMix10μL,10μmol/L上、下游引物各0.5μL,DNA模板2μL,ddH2O12μL;反应条件:95℃,3min变性;95℃,30s;不同退火温度见表1,30s;72℃,延伸1min,40个循环。1.5.3qPCR标准品与标准曲线的制作...