IF: 50.5! NanoTemper 解密 Nature 顶刊蛋白质与核酸互作发文思路
当蛋白质形成复合物后,进一步的功能探究,如蛋白复合物与核酸的相互作用,通过Monolith系列仪器进行的实验设计更为简便,能够直观地展示相互作用的结果,从而凸显您研究的分子功能。Monolith分子互作检测仪
Science最新封面 | 用突破性技术建模蛋白复合物
2024年4月19日《Science》最新期刊,封面是研究人员开发深度学习方法(RFAA)预测出的蛋白质复合结构,显示了氨基酸和短肽的背景云,它们聚集在一起,形成了目标配体血红素(橙色)周围的中央蓝色蛋白质。(图1)蛋白质的生化功能大多基于与体内其他物质形成复合物或者相互作用,很少能单独起作用。近年来,机器学习的进步使蛋白...
...大佬手把手教授!|蛋白|蛋白质|多肽|核酸|大分子|复合物_网易订阅
这一最新模型能预测含有蛋白质数据库(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)如何聚集在一起并相互作用,以及预测翻译后修饰和离子对这些分子系统的结构影响,从而帮助我们在原子水平上精确地观察生物分子系统的结构。这种用计算机解析蛋白质与其他分子复杂相互作...
AlphaFold3向解码分子行为生物计算迈出重要一步,Nature子刊锐评
今年5月初,谷歌DeepMind推出了AlphaFold3,它在预测蛋白质-蛋白质、蛋白质-配体和蛋白质-核酸复合物的3D结构方面,已经超越了大多数专业的先进工具。AlphaFold3在多个测试数据集中实现了预测准确率的显著提升。值得注意的是,AlphaFold3在2??的实验误差范围内,预测了大约80%的蛋白质-配体复合物,优于Au...
线粒体前蛋白输入的分子途径,PCR Clean??高效清除核酸污染
大多数线粒体蛋白在细胞核中编码,由细胞质中的核糖体合成,然后输入线粒体室。线粒体已经进化出复杂的输入系统,以促进蛋白质在其膜上的易位。外膜(TOM)复合体的转位酶介导大多数蛋白质进入线粒体。通过TOM复合物后,蛋白质被分类并根据目的地传递到不同的蛋白质转运机制。超过一半的线粒体蛋白遵循前序列途径...
Nature|Alphafold 3.0:AI 蛋白质预测器的升级
共价修饰(结合配体、糖基化、修饰的蛋白残基和202个核酸碱基)也可以通过AF3准确预测,包括对任何聚合物残基(蛋白质、RNA或DNA)的修饰(www.e993.com)2024年7月28日。其准确率可能因共价修饰的类型不同而有所不同。AF3也提高了蛋白质复合物的准确性,特别是抗体-蛋白相互作用预测有了显著提高,蛋白单体LDDT的改善也很显著。AF3对MSA深度的依赖...
AlphaFold3来了!全面预测蛋白质与所有生命分子相互作用及结构...
该研究推出了AlphaFold3,这是一个强大的结构预测统一框架,涵盖了前所未有的广度和精确度,能够高准确性预测蛋白质与其他各种生物分子相互作用的结构。这一最新模型能预测含有蛋白质数据库(ProteinDataBank)内几乎所有分子类型的复合物的结构,包括配体(小分子)、蛋白质、核酸(DNA和RNA)如何聚集在一起并相互作用,以及...
2024 AI+蛋白质行业研究报告|智药研究
AI蛋白质预测和蛋白质设计可以大大加速新药研发进程。通过预测蛋白质的结构和功能,研究人员可以更准确地确定药物与蛋白质之间的相互作用,从而设计出更有效的小分子药物和生物药。还可以通过预测蛋白质与特定分子的相互作用来检测疾病标志物,这对在疾病的早期发现、诊断和预后评估方面具有重要价值。
斯坦福博士图解AlphaFold 3:超多细节+可视化还原ML工程师眼中的AF3
AF3不仅预测单个蛋白质序列(AF2)或蛋白质复合物(AF-multimeter)的结构,还能预测蛋白质与其他蛋白质、核酸、小分子中的一种或多种物质的复合结构,而且仅根据序列信息。因此,前代的AF模型只需表示标准的氨基酸序列,但AF3需要引入更复杂的输入类型,因此设计了更复杂的特征表示和tokenization机制。
「AlphaFold 3」要来了?DeepMind推出新一代蛋白质结构预测工具,已...
更进一步说,蛋白质和小分子复合物的结构预测,应该是结合了AI和CADD两种方法,即分别基于数据库和物理原理,第三大升级:预测核酸、以及翻译后修饰结构。核酸是关键遗传信息的携带者,并破译翻译后修饰--即蛋白质诞生后发生的化学变化。例如,在CasLambda与crRNA以及DNA结合的结构中,CasLambda共享CRISPR-...